Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms