Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF3P57682 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms