Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLE2P56282 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE2P56282 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE2P56282 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE2P56282 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE2P56282 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLE2P56282 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLE2P56282 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms