Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA4P54764 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms