Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms