Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms