Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms