Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP5P45974 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP5P45974 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP5P45974 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms