Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCAMP43121 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCAMP43121 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCAMP43121 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms