Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35P42766 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL35P42766 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL35P42766 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35P42766 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms