Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PIK3CBP42338 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms