Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ECI1P42126 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECI1P42126 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECI1P42126 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms