Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms