Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGP37231 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms