Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCGF2P35227 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms