Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms