Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB2P29033 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB2P29033 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB2P29033 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB2P29033 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms