Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms