Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD1P21695 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD1P21695 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD1P21695 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPD1P21695 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms