Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD33P20138 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD33P20138 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD33P20138 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD33P20138 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms