Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLP19338 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLP19338 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLP19338 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms