Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF3P18847 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF3P18847 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF3P18847 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF3P18847 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF3P18847 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF3P18847 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF3P18847 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF3P18847 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF3P18847 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF3P18847 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF3P18847 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF3P18847 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms