Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLT1P17948 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FLT1P17948 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FLT1P17948 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT1P17948 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms