Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms