Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA1P15085 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms