Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFAP13804 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms