Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms