Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms