Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPD1P10809 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms