Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI4P10075 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI4P10075 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI4P10075 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI4P10075 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI4P10075 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI4P10075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI4P10075 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms