Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L5P0DN76 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms