Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms