Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2P0DI81 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms