Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms