Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms