Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEFMP07197 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms