Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD1O95696 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD1O95696 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD1O95696 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms