Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms