Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH1O95406 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH1O95406 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms