Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN15O75808 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms