Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA4O75676 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms