Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA3O75145 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms