Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND1O60716 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms