Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms