Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDIL3O43854 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDIL3O43854 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms