Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms