Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1GO43497 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms