Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms