Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGFO15240 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VGFO15240 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGFO15240 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGFO15240 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms