Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1CO15160 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms